Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SSPNQ14714 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms