Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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