Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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