Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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