Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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