Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms