Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKHD1P08F94 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKHD1P08F94 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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