Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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