Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ERVV-1B6SEH8 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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