Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms