Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms