Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DTX3Q8N9I9 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DTX3Q8N9I9 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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