Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM187BQ17R55 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms