Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CTF1Q16619 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms