Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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