Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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SGCBQ16585 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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SGCBQ16585 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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