Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms