Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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DDX39BQ13838 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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