Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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