Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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