Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms