Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NME3Q13232 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NME3Q13232 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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