Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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