Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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