Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms