Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms