Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SelenofQ9ERR7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms