Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms