Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms