Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRUQ92729 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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