Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3bQ8BHK2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3bQ8BHK2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms