Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms