Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3F3CQ6NXT2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms