Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms