Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms