Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hp1bp3Q3TEA8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hp1bp3Q3TEA8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms