Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA4P83105 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms