Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCL1P53675 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms