Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VhlP40338 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VhlP40338 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VhlP40338 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VhlP40338 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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