Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4AP35499 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms