Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms