Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd4P06332 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms