Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H7C1D1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C1D1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C1D1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C1D1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C1D1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms