Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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