Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms