Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms