Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms