Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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