Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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RTL8BQ17RB0 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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