Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms